PROSITE entry PS50296

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50296
Entry name [info]	SUI1
Accession [info]	PS50296
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-DEC-2001 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00862
Associated ProRule [info]	PRU00200

Name and characterization of the entry

Description [info]

Translation initiation factor SUI1 family profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=71;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=66;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.2859000; R2=0.0154785; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4167.2734375; R2=3.9856045; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=467; H_SCORE=6029; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=337; H_SCORE=5510; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-60; B1=-60; E0=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='I';  M= -6,-29,-21,-35,-29,  0,-35,-29, 38,-24, 16, 15,-24,-25,-23,-23,-16, -6, 36,-24, -5,-29;
/M: SY='H';  M=-12, -2,-27, -3,  2,-21,-23, 17,-14,  3,-13, -2, -1,-15,  8,  2, -7, -7,-14,-25, -2,  3;
/M: SY='I';  M= -9,-29,-26,-38,-29,  2,-37,-28, 44,-27, 18, 21,-21,-22,-21,-27,-19, -9, 31,-21, -1,-29;
/M: SY='R';  M=-10, -9,-26,-11, -2,-13,-20, -4,-16, 15,-14, -4, -4,-17,  3, 27, -6, -4,-11,-17,  0, -3;
/M: SY='I';  M= -8,-12,-22,-17, -8,-10,-26,-17,  5, -7,  3,  2, -9,-17, -6, -4, -7,  5,  4,-24, -7, -9;
/M: SY='Q';  M=  0, -3,-23, -4, 10,-23,-18, -9, -9, -4,-11, -6, -5,-11, 11, -7,  1,  1, -9,-25,-13, 10;
/M: SY='Q';  M= -6, -4,-26, -3, 12,-27,-18, -3,-18, 12,-18, -4, -3, -7, 20, 11, -1, -4,-17,-24,-13, 16;
/M: SY='R';  M=-15,-10,-30,-10, -2,-22,-10, -4,-30, 23,-22,-11, -1,-15,  5, 52, -8,-11,-21,-20,-13, -2;
/M: SY='R';  M= -5,  5,-22, -3, -3,-19,-12, -3,-17,  7,-19,-11, 16,-17,  3, 20,  3,  1,-16,-28,-14, -2;
/M: SY='G';  M= -6, -9,-28,-10,-11,-14, 21,-13,-29,  1,-24,-13, -3,-18,-11, -4, -4,-13,-21,-14, -9,-11;
/M: SY='R';  M=-11, -1,-28, -4, -5,-24, 12, -5,-32, 11,-26,-15, 10,-19, -1, 27, -4,-12,-25,-23,-18, -5;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 49,-30,-10,  0,-10, 10, 31,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='T';  M= -6, -9,-15,-11, -6, -8,-15,-13,-12, -2,-11, -8, -7,-17, -8, -4,  1,  6, -5,-22, -4, -7;
/M: SY='V';  M= -4,-29,-16,-31,-26,  1,-30,-25, 29,-21, 19, 16,-27,-27,-24,-19,-16, -4, 35,-26, -6,-26;
/M: SY='T';  M=  0, -2, -5,-11,-11,-10,-20,-21, -9,-11,-10,-10, -2,-12,-11,-11, 18, 44,  2,-31,-11,-11;
/M: SY='V';  M= -3,-16,-17,-21,-17, -7,-25,-21,  9,-11,  3,  2,-13,-19,-14, -7, -3, 11, 14,-26, -8,-17;
/M: SY='V';  M= -3,-30,-17,-33,-30,  0,-33,-30, 37,-23, 13, 13,-27,-27,-27,-23,-13, -3, 43,-27, -7,-30;
/M: SY='Q';  M= -4,  1,-16,  1, 13,-27,-15, -5,-23,  5,-23,-12,  2,-10, 17,  4, 11,  5,-19,-30,-15, 14;
/M: SY='G';  M= -2, -1,-28, -5,-17,-28, 58,-15,-37,-17,-30,-20, 10,-20,-17,-17,  2,-17,-30,-23,-28,-17;
/M: SY='L';  M=-11,-30,-22,-33,-24, 16,-32,-22, 24,-29, 35, 19,-26,-27,-22,-22,-25,-10, 15,-17,  3,-23;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='E';  M=  7,  8,-24, 12, 18,-29,-11, -8,-24,  2,-21,-18,  0,  1,  4, -8,  4, -5,-19,-29,-20, 11;
/M: SY='Y';  M= -7,-12,-21,-13, -7, -2,-23,-12, -4, -2,  1,  0,-12,-19, -9, -4, -9,  0, -1,-16,  3, -9;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='D';  M= -8, 14,-28, 23, 16,-31,  7, -6,-32, -4,-23,-20,  5,-11,  2,-10,  1,-11,-26,-30,-21,  9;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='I';  M= -8,-23,-24,-28,-21,  9,-30,-18, 22,-22, 15, 11,-19,-23,-18,-21,-17, -8, 14,-13,  9,-21;
/M: SY='D';  M=-11, 29,-27, 40, 17,-32, -9, -4,-29,  0,-25,-23, 13,-10,  1, -9,  2, -7,-23,-35,-19,  9;
/M: SY='L';  M=-10,-23,-25,-23,-13, -1,-27,-15,  8,-18, 21, 10,-23, -7,-11,-15,-21, -8,  0,-19, -1,-13;
/M: SY='K';  M= -7,  5,-27,  6, 12,-25,-17, -6,-26, 26,-25,-13,  2,-10,  8, 13, -3, -4,-19,-22, -8,  9;
/M: SY='K';  M= -5,  3,-25,  6, 16,-26,-15, -8,-25, 19,-23,-14,  1,-10,  7, 11,  3, -4,-17,-28,-15, 11;
/M: SY='L';  M= -1,-27,-19,-31,-22, 10,-27,-22, 20,-26, 27, 14,-24,-25,-21,-21,-19, -8, 15,-18, -1,-22;
/M: SY='A';  M= 22,-14,-14,-20,-13,-13, -8,-19, -1,-15, -1, -3,-12,-16,-11,-18,  3,  0,  4,-23,-15,-12;
/M: SY='K';  M=  5, -3,-23, -6,  3,-25,-13,-11,-24, 26,-24,-11, -1,-11,  4, 19,  1, -4,-14,-23,-14,  3;
/M: SY='E';  M= -1,  0,-23,  2,  4,-15,-18,-12,-10, -4, -7, -7, -5,-12, -5, -9, -4, -3, -7,-24,-10, -1;
/M: SY='L';  M=-12,-29, -8,-32,-23, 21,-30,-21, 12,-30, 36, 13,-27,-31,-25,-21,-26,-10,  6,-17,  3,-23;
/M: SY='K';  M=  0, -3,-27, -4,  5,-29,-11,-10,-26, 30,-25,-10, -2,-11, 10, 19, -5, -9,-19,-20,-13,  7;
/M: SY='K';  M= -4,  3,-26,  2,  9,-30,-15, -5,-26, 25,-27,-11,  4,-11, 16, 16,  2, -5,-20,-25,-13, 12;
/M: SY='K';  M=-11, -3,-29, -3,  6,-21,-17, -9,-21, 23,-20, -9, -2,-14,  4, 23, -9,-10,-16,-21,-10,  3;
/M: SY='C';  M=-11,-25, 31,-34,-28, 30,-28,-24, -9,-29,  3, -5,-21,-33,-32,-24,-16, -9, -2,-17,  2,-28;
/M: SY='A';  M= 28, -8, -6,-15,-10,-23,  9,-17,-18,-12,-17,-13, -4,-14, -8,-17,  9, -3, -9,-25,-22, -9;
/M: SY='C';  M=  0,-13, 65,-22,-22,-19,-18,-26,-24,-22,-18,-17,-12,-28,-22,-23,  1,  4, -8,-40,-24,-22;
/M: SY='G';  M=  0,  3,-23, -1,-11,-26, 40,-11,-31,-14,-30,-20, 15,-18,-11,-14, 11, -7,-26,-29,-26,-11;
/M: SY='G';  M=  6, -8,-15,-11,-16,-23, 33,-20,-28,-17,-23,-17, -1,-17,-16,-18,  8,  1,-18,-25,-24,-16;
/M: SY='T';  M=  8,  0,-10, -7, -6,-15,-10,-16,-14,-10,-18,-14,  4,-10, -6,-11, 26, 33, -4,-33,-15, -6;
/M: SY='V';  M=  2,-28,-13,-30,-28, -1,-29,-29, 28,-21, 12, 10,-27,-27,-27,-21,-11, -2, 41,-27, -9,-28;
/M: SY='K';  M= -4, -7,-20,-10, -7,-16,-17,-17, -6,  5,-14, -5, -4,-16, -7, -1,  0,  4,  2,-27,-12, -7;
/M: SY='E';  M=-10, 12,-29, 15, 20,-30, -9, -4,-30, 16,-27,-17,  9, -4,  9,  6, -2, -9,-27,-28,-18, 14;
/I:         I=-4; MD=-19;
/M: SY='G';  M= -4,  6,-24,  8, -3,-23, 12, -4,-24,-11,-17,-14,  5,-16, -8,-13,  0, -8,-19,-28,-17, -6; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-19;
/M: SY='P';  M=  1, -7,-19, -4,  1,-17, -9, -9,-11, -3,-15, -9, -8, 30, -1, -8, -2, -4,-14,-16,-14, -2; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='E';  M= -6,  3,-15,  6, 15,-11,-11, -3,-15,  6,-11, -8,  0, -5,  6,  1,  0, -3,-13,-14, -7, 11; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='K';  M= -7, -2,-16,  0,  1, -9,-10, -1,-10,  8, -6, -2, -3,-10,  0,  3, -7, -6, -9,-10,  1,  0; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='G';  M=  0, -4, -8, -5, -7,-16, 15, -5,-20, -3,-17,-10,  0,-11, -6, -5,  0, -7,-14,-16,-13, -7; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='E';  M= -4,  5,-17, 10, 18,-15,-11, -1,-15,  1, -9, -9, -1, -6,  7, -3, -1, -5,-14,-17, -7, 12; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='E';  M= -7, -7,-19, -5, 12,-20,-24,-10, -5, -3, -9, -5,-10,-14,  7, -4, -4, -6, -2,-28,-13,  8;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-24,-36,-29,  1,-36,-29, 42,-27, 20, 17,-24,-24,-23,-26,-18, -7, 34,-23, -3,-29;
/M: SY='Q';  M= -9, -2,-27,  2, 22,-27,-22, -3,-12,  2,-11, -5, -6,-11, 24, -2, -4, -9,-14,-26,-13, 23;
/M: SY='I';  M= -8,-30,-23,-35,-26,  4,-35,-26, 35,-28, 30, 18,-25,-25,-22,-25,-22, -8, 25,-22, -2,-26;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='D';  M=-16, 39,-29, 50, 17,-35, -6, -1,-35, -1,-29,-27, 22, -5,  0, -9,  1, -9,-30,-38,-21,  8;
/M: SY='H';  M=-11, -9,-26,-10,  0,-18,-23, 21,-10, -2,-10,  2, -5,-18, 17,  0, -8,-11,-10,-23,  0,  7;
/M: SY='R';  M=-11,-12,-24,-15, -9,-15,-16,-10,-10,  8,-12, -2, -5,-20, -3, 25, -6, -4, -2,-24,-11, -9;
/M: SY='D';  M=-13, 13,-29, 19, 11,-27,-12,  9,-28,  8,-23,-15,  6,-13,  6,  3, -5,-11,-24,-25, -6,  8;
/M: SY='N';  M=-11,  9,-25,  8,  5,-17,-15,  2,-21,  5,-16,-11, 10,-16,  1,  6, -3, -7,-19,-28,-10,  3;
/M: SY='I';  M= -5,-30,-20,-33,-27,  2,-33,-27, 34,-26, 23, 16,-26,-26,-23,-24,-18, -6, 31,-24, -4,-27;
/M:         M= -5,-11,-11,-13, -3,-15,-17,-10,-10, -1, -9, -4, -8,-17, -6, -6, -7, -8, -7,-26,-11, -5;
/M: SY='E';  M= -9, 12,-26, 16, 18,-26,-16, -5,-26,  4,-22,-17,  4, -9,  9,  0,  3,  0,-22,-20,-13, 14;
/M: SY='F';  M=-15,-25,-23,-28,-19, 29,-29, -8,  7,-23, 17,  6,-21,-27,-22,-17,-21,-11,  2, -1, 20,-20;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-22,-32,-22,  7,-32,-21, 27,-29, 40, 23,-27,-27,-19,-22,-27,-10, 15,-20,  0,-22;
/M: SY='L';  M= -4,-12,-20,-14, -5,-10,-23,-11,  2,-12,  3,  0,-10,-15, -8,-11, -6,  1,  3,-27, -9, -7;
/M: SY='E';  M= -6,  8,-27, 12, 29,-30,-16, -2,-27, 16,-24,-15,  4, -7, 18,  7,  2, -6,-24,-28,-16, 23;
/M: SY='K';  M= -5, -8,-24,-10,  2,-17,-21, -6,-10,  8, -6,  1, -8,-15,  5,  4, -8, -4, -9,-23, -8,  3;
/M: SY='G';  M= -8,-16,-31,-16,-20, -7, 25,-13,-23,-19,-14,-12,-11,-24,-18,-18,-12,-18,-21, 10,  3,-20;
/I:         E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_01 which contains 572'970 sequence entries.

Total number of hits	114 in 114 different sequences
Number of true positive hits	113 in 113 different sequences
Number of 'unknown' hits	1
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Archaea, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	K_Hofmann, N_Hulo
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	SUI1
Version [info]	5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

113 sequences

DENR_ASPCL  (A1C8E3), DENR_ASPFU  (Q4WBL6), DENR_ASPNC  (A2QHG9),

DENR_ASPOR  (Q2TVZ2), DENR_BOTFB  (A6SIZ0), DENR_BOVIN  (Q2HJ47), 
DENR_CAEEL  (Q9NAH4), DENR_CANGA  (Q6FXQ4), DENR_CHAGB  (Q2H5Z7), 
DENR_CHICK  (Q5ZJ39), DENR_COCIM  (Q1E556), DENR_CRYNB  (P0CR81), 
DENR_CRYNJ  (P0CR80), DENR_DANRE  (Q6DH65), DENR_DEBHA  (Q6BH22), 
DENR_DICDI  (Q54WG0), DENR_DROME  (Q9VX98), DENR_EREGS  (Q75CN1), 
DENR_HUMAN  (O43583), DENR_KLULA  (Q6CJ30), DENR_LODEL  (A5E3R9), 
DENR_MOUSE  (Q9CQJ6), DENR_NEOFI  (A1DAY1), DENR_NEUCR  (Q9P3T4), 
DENR_PICGU  (A5DGV3), DENR_PICST  (A3LSY0), DENR_PONAB  (Q5RFP5), 
DENR_PYRO7  (A4QVI3), DENR_SCHPO  (O42929), DENR_VANPO  (A7TES6), 
DENR_XENLA  (Q6GLZ1), DENR_XENTR  (Q6DFN7), DENR_YARLI  (Q6CA08), 
DENR_YEAS7  (A6ZPY2), DENR_YEAST  (P47089), EIF1B_HUMAN (O60739), 
EIF1B_MACFA (Q4R4X9), EIF1B_MOUSE (Q9CXU9), EIF1B_PIG   (P61220), 
EIF1_BOVIN  (Q5E938), EIF1_CHICK  (P51971), EIF1_HUMAN  (P41567), 
EIF1_MOUSE  (P48024), EIF1_PONAB  (Q5RFF4), EIF2D_BOVIN (Q58CR3), 
EIF2D_HUMAN (P41214), EIF2D_MOUSE (Q61211), EIF2D_PONAB (Q5RA63), 
EIF2D_RABIT (P0CL18), EIF2D_RAT   (Q5PPG7), ETIF1_ANOGA (P42678), 
ETIF1_DROME (Q9VZS3), SUI11_ARATH (P41568), SUI12_ARATH (Q94JV4), 
SUI1_AERPE  (Q9YBG9), SUI1_ARCFU  (O29348), SUI1_BRAOL  (Q9SQF4), 
SUI1_CENSY  (A0RWW9), SUI1_EREGS  (Q755R1), SUI1_HALLT  (B9LR02), 
SUI1_HALMA  (Q5UZP9), SUI1_HALS3  (B0R868), SUI1_HALSA  (Q9HME3), 
SUI1_HYPBU  (A2BIX0), SUI1_IGNH4  (A8AC05), SUI1_MAIZE  (P56330), 
SUI1_METAC  (Q8TIT3), SUI1_METB6  (A7I9K6), SUI1_METBF  (Q46F27), 
SUI1_METBU  (Q12UF1), SUI1_METHJ  (Q2FTC8), SUI1_METJA  (Q57902), 
SUI1_METKA  (Q8TX33), SUI1_METLZ  (A2SQ91), SUI1_METM5  (A4FWB4), 
SUI1_METM6  (A9A9Q7), SUI1_METM7  (A6VGZ2), SUI1_METMA  (Q8PYK3), 
SUI1_METMJ  (A3CX23), SUI1_METMP  (Q6LXE5), SUI1_METPE  (B8GDE2), 
SUI1_METS5  (A4YIU6), SUI1_METST  (Q2NFW4), SUI1_METTH  (O26118), 
SUI1_METTP  (A0B635), SUI1_METVA  (P14021), SUI1_MIMIV  (Q5UQD7), 
SUI1_NATPD  (Q3IU96), SUI1_NITMS  (A9A389), SUI1_ORYSI  (A6MZM2), 
SUI1_ORYSJ  (Q0D5W6), SUI1_PICTO  (Q6L1B9), SUI1_PYRAB  (Q9V1U3), 
SUI1_PYRAE  (Q8ZTB0), SUI1_PYRFU  (Q8U006), SUI1_PYRHO  (P58193), 
SUI1_SALBA  (O48650), SUI1_SCHPO  (P79060), SUI1_SPOST  (Q9SM41), 
SUI1_SPUBR  (O82569), SUI1_SULAC  (Q4JAE7), SUI1_SULTO  (Q975S0), 
SUI1_THEGJ  (C5A278), SUI1_THEKO  (Q5JDH7), SUI1_THEON  (B6YSM1), 
SUI1_THEVO  (Q97BW9), SUI1_YEAST  (P32911), TMA64_YEAST (Q04600), 
Y1225_HAEIN (P45116), Y546_SYNY3  (Q55397), YCIH_ECOLI  (P08245), 
YCIH_SALTI  (P0A2G8), YCIH_SALTY  (P0A2G7)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
'Unknown' sequences

1 sequence

RM49_DROME  (Q9VYI3)

PDB
[Detailed view]

37 PDB

1D1R; 2IF1; 2OGH; 2RVH; 3J80; 3J81; 3JAM; 3JAP; 4KZX; 4KZY; 4MO0; 5JB3;
» more