PROSITE entry PS50045
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| PURL [info] | https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50045 |
| Entry name [info] | SIGMA54_INTERACT_4 |
| Accession [info] | PS50045 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-NOV-1997 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC00579 |
| Associated ProRule [info] | PRU00193 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Sigma-54 interaction domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=230; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=225; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.4518000; R2=0.0129291; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=570.4483032; R2=21.7931042; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=623; H_SCORE=14148; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=468; H_SCORE=10770; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='I'; M= -8,-25,-23,-31,-22, 4,-27,-19, 24,-23, 23, 24,-22,-21,-16,-20,-19, -8, 15,-20, -2,-20; /M: SY='I'; M= -5,-24,-22,-28,-22, -3,-28,-20, 22,-17, 8, 10,-19,-20,-17,-13,-12, -5, 21,-23, -5,-22; /M: SY='G'; M= 1,-10,-25,-12,-17,-24, 41,-19,-29,-16,-24,-16, -3,-19,-15,-16, 2, -9,-20,-18,-23,-16; /M: SY='R'; M= -8, 0,-26, 1, 9,-23,-17, -2,-20, 7,-15,-10, 0, -9, 8, 11, -3, -5,-18,-26,-13, 7; /M: SY='S'; M= 4, 6,-14, 5, 1,-22, -2, -7,-21, -6,-26,-18, 11,-12, -2, -8, 23, 11,-13,-36,-18, -1; /M: SY='P'; M= -3, -9,-29, -5, 6,-27,-13,-11,-21, -2,-24,-14, -7, 29, 3, -5, 0, -4,-22,-28,-22, 3; /M: SY='A'; M= 17,-12,-19,-16, -8,-17, -7,-13,-10, -9,-12, -8,-10, -8, -6,-13, 2, -2, -6,-14,-11, -8; /M: SY='M'; M= -8,-21,-18,-29,-21, 7,-23, -9, 16,-16, 17, 34,-19,-22,-10,-14,-16, -5, 10,-17, 3,-15; /M: SY='Q'; M= -7, -1,-25, -3, 7,-23,-17, -1,-17, 7,-12, -4, 1,-14, 18, 10, -3, -4,-18,-24,-10, 12; /M: SY='Q'; M= -1, 1,-24, 1, 11,-26,-13, 0,-23, 10,-20,-11, 2,-12, 14, 11, 1, -5,-19,-25,-13, 11; /M: SY='L'; M= 0,-25,-17,-28,-22, 2,-24,-22, 17,-21, 19, 11,-23,-25,-20,-17,-15, -5, 19,-22, -6,-21; /M: SY='Y'; M=-11,-21,-19,-24,-17, 0,-28,-10, 6, -7, 4, 5,-16,-24,-11, 0,-16, -9, 5,-13, 7,-17; /M: SY='E'; M= -7, 4,-26, 6, 20,-28,-16, 7,-26, 10,-21,-12, 4,-10, 18, 12, 1, -7,-24,-27,-13, 18; /M: SY='Q'; M= -9,-11,-24,-13, 0,-10,-24,-10, -2, -7, 3, 3,-10,-17, 5, -3, -9, -3, -6,-20, -6, 2; /M: SY='I'; M= 12,-21,-19,-28,-21, -8,-16,-24, 15,-20, 7, 6,-17,-18,-17,-22, -8, -5, 15,-22,-11,-20; /M: SY='K'; M= -2, -1,-23, 0, 8,-25,-12, -6,-23, 12,-19,-10, -1,-13, 7, 12, -2, -7,-16,-25,-14, 6; /M: SY='R'; M= -7, -9,-25,-11, -1,-20,-20, -2,-13, 10,-12, -2, -4,-17, 11, 20, -5, -7,-11,-22, -9, 3; /M: SY='V'; M= 4,-25,-14,-29,-24, 3,-24,-24, 19,-21, 12, 8,-24,-25,-23,-20,-10, -3, 27,-23, -6,-24; /M: SY='A'; M= 32,-11,-12,-19,-11,-17, -3,-18, -6,-11, -9, -4, -9,-13, -9,-18, 10, 2, 2,-24,-17,-11; /M: SY='R'; M= -7, -2,-25, -3, 1,-18,-13, -7,-18, 2,-16, -9, 1, -4, 2, 7, -2, -5,-17,-25,-13, 0; /I: I=-5; MI=0; IM=0; DM=-20; MD=-20; /M: SY='T'; M= 0, -3,-14, -7, -6, -8, -9,-13,-13,-12,-12,-12, 0,-15, -9,-12, 13, 15, -8,-25, -9, -7; /M: SY='D'; M=-13, 22,-28, 31, 14,-32, -7, 1,-32, 3,-27,-21, 13, -7, 6, 0, 3, -7,-27,-33,-18, 9; /M: SY='V'; M= 7,-17,-16,-22,-15, -5,-19,-19, 7,-15, 6, 4,-14,-19,-11,-16, -4, -1, 8,-23, -8,-14; /M: SY='P'; M= -1, 0,-22, -1, -2,-22,-13,-10,-18, -8,-23,-16, 1, 18, -6,-12, 9, 11,-16,-32,-19, -6; /M: SY='V'; M= -3,-30,-15,-32,-28, 1,-31,-28, 32,-22, 16, 15,-28,-28,-26,-21,-14, -3, 41,-27, -7,-28; /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-30,-21, 12,-29,-18, 17,-27, 42, 20,-29,-29,-19,-19,-29,-10, 8,-12, 3,-20; /M: SY='I'; M=-10,-30,-24,-35,-26, 10,-35,-26, 33,-29, 29, 17,-25,-25,-23,-25,-23, -9, 22,-18, 2,-26; /I: I=-10; MI=-32; MD=-32; IM=-32; /M: SY='T'; M= -6, -6, -9,-12, -8, -7,-19, -8, -9, -9, -5, -5, -2,-20, -6, -3, -1, 4, -7,-25, -6, -7; D=-6; /I: DM=-32; /M: SY='x'; /M: SY='x'; /M: SY='x'; /M: SY='x'; /M: SY='x'; /M: SY='x'; /M: SY='x'; /M: SY='x'; /M: SY='L'; M= -8,-22,-16,-24,-18, 5,-27,-14, 12,-22, 24, 12,-20,-26,-17,-17,-17, -2, 10,-23, -2,-18; /M: SY='L'; M= -8,-27,-18,-31,-25, 16,-27,-24, 18,-26, 20, 10,-23,-26,-25,-21,-17, -4, 17,-17, 1,-25; /M: SY='A'; M= 46, -9,-11,-18, -7,-20, -1,-19,-11, -9,-11,-11, -9,-10, -8,-19, 11, 1, -2,-21,-20, -8; /M: SY='R'; M=-12, -3,-27, -5, 3,-22,-17, 6,-23, 17,-20, -8, 5,-16, 13, 33, -4, -8,-20,-23, -8, 5; /M: SY='A'; M= 21,-11,-17,-17,-10,-13, -5,-14,-11, -6, -7, -6, -8,-16, -8, -6, 2, -3, -5,-19,-10,-10; /M: SY='I'; M= -9,-28,-20,-35,-26, 0,-36,-26, 36,-27, 22, 18,-22,-23,-18,-25,-20, -9, 23,-22, -2,-25; /M: SY='H'; M=-20, -2,-30, -2, -1,-17,-21, 94,-28,-11,-17, 1, 8,-21, 8, -1,-11,-19,-28,-27, 22, -1; /M: SY='E'; M= -9, 5,-25, 3, 6,-12,-16, 1,-16, -1,-12, -9, 5,-16, 6, 0, -3, -4,-18,-19, 1, 5; /M: M= -1,-11,-22,-13, -4, -6,-10, -7,-11,-11, -4, -4, -8,-18, -6, -9, -6, -7,-10,-15, -5, -5; /M: SY='S'; M= 9, -3,-13, -3, -3,-19, 4,-11,-20,-10,-26,-18, 6,-12, -3,-11, 30, 13,-11,-35,-19, -3; /I: MD=-12; /M: SY='P'; M= -4, -5,-26, -4, 1,-17,-15,-11,-15, -1,-16,-11, -5, 8, -3, -3, -4, -6,-15,-23,-14, -3; D=-2; /I: I=-5; MI=0; IM=0; DM=-12; /M: SY='R'; M=-14, -6,-28, -8, 0,-21,-15, 2,-28, 23,-21,-10, 3,-19, 9, 51, -7, -9,-20,-21,-10, 0; /M: SY='A'; M= 14, -9,-18,-14, -6,-18, -9,-12,-16, 2,-15, -9, -4,-14, -1, 6, 3, -4, -9,-20,-14, -5; /M: SY='N'; M= -3, 8,-23, 7, 5,-24, -4, -7,-23, 4,-23,-15, 9,-13, 2, 0, 6, 0,-18,-29,-16, 3; /M: SY='G'; M= 1, -5,-25, -7, -5,-24, 16,-12,-27, 2,-22,-13, 1,-15, -5, 0, 0, -8,-20,-23,-19, -6; /M: SY='P'; M= -5,-17,-35,-11, -2,-27,-18,-18,-18, -6,-26,-17,-16, 64, -9,-13, -7, -8,-23,-29,-26, -9; /M: SY='F'; M=-18,-27,-21,-35,-24, 61,-29,-16, 2,-26, 13, 4,-20,-28,-31,-18,-20,-10, 0, 5, 26,-24; /M: SY='V'; M= -5,-30,-18,-33,-29, 1,-33,-28, 35,-24, 16, 14,-26,-26,-25,-23,-15, -4, 39,-25, -4,-29; /M: SY='A'; M= 14, -8,-18,-12, -4,-18,-11,-14,-14, 2,-15,-10, -7, -8, -5, -2, 4, 3, -5,-22,-13, -5; /M: SY='V'; M= -3,-25,-18,-29,-22, 6,-28,-21, 21,-21, 15, 12,-23,-25,-20,-20,-14, -6, 23,-20, -1,-22; /M: SY='N'; M=-11, 35,-21, 19, 4,-22, -3, 9,-21, 2,-29,-19, 52,-19, 4, 3, 8, -1,-30,-38,-19, 4; /M: SY='C'; M= -6,-20, 90,-30,-27,-16,-28,-27,-20,-28,-12,-11,-20,-36,-26,-28,-11, -9, -6,-44,-25,-27; /M: SY='A'; M= 33, -9,-15,-16, -8,-22, 8,-18,-17, -9,-15,-12, -7,-10, -8,-15, 8, -2, -8,-21,-21, -9; /M: SY='A'; M= 28, -6,-14,-11, -8,-20, -2,-18,-13,-12,-10,-11, -8, -8,-10,-18, 6, 1, -5,-24,-19, -9; /M: SY='L'; M=-11,-27,-24,-30,-20, 5,-33,-16, 25,-25, 29, 16,-23,-25,-17,-21,-23,-10, 14,-17, 6,-21; /M: SY='P'; M= -6,-11,-31, -7, -2,-24,-14,-14,-18, -8,-25,-17, -8, 47, -6,-13, -1, -3,-24,-28,-21, -7; /M: SY='E'; M= -3, 8,-27, 12, 25,-28, -8, -5,-26, 5,-21,-16, 3, -2, 6, -2, 0, -8,-23,-28,-20, 15; /I: MD=-15; /M: SY='B'; M= -2, 14,-18, 14, 10,-23, -6, -4,-21, -3,-22,-17, 13,-10, 2, -7, 12, 5,-17,-32,-17, 6; D=-2; /I: I=-5; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='L'; M= -6,-20,-17,-20,-15, 1,-24,-17, 12,-21, 27, 11,-21,-23,-15,-15,-16, -3, 10,-22, -4,-15; D=-2; /I: DM=-15; /M: SY='L'; M= 7,-22,-19,-26,-19, -4,-14,-21, 11,-22, 17, 9,-19,-22,-17,-21,-12, -7, 9,-21, -9,-19; /M: SY='E'; M=-10, 3,-30, 10, 39,-27,-15, -4,-24, 5,-16,-13, -3, 1, 13, -3, -3,-11,-25,-28,-18, 26; /M: SY='S'; M= 7, -3,-14, -3, -1,-19, -5, -7,-16,-10,-20,-14, 4,-12, 1,-10, 25, 11,-10,-34,-15, 0; /M: SY='E'; M= -5, 6,-27, 12, 41,-26,-16, -3,-25, 4,-18,-16, -1, -4, 15, -3, 2, -6,-24,-28,-18, 28; /M: SY='L'; M= -6,-27,-19,-29,-20, 12,-28,-20, 16,-28, 40, 16,-26,-27,-20,-20,-24, -7, 9,-18, 0,-20; /M: SY='F'; M=-18,-29,-20,-37,-28, 66,-27,-20, 1,-29, 11, 2,-20,-27,-36,-20,-19, -9, 0, 5, 24,-28; /M: SY='G'; M= 1,-10,-29,-11,-19,-28, 62,-20,-35,-20,-28,-18, -1,-19,-19,-20, 1,-18,-26,-21,-28,-19; /M: SY='H'; M=-11, -4,-23, -4, -5,-15,-18, 41,-19, -8,-15, -4, 0,-18, 1, -2, -6, -9,-15,-24, 10, -5; /M: SY='E'; M= -4, -2,-23, 0, 17,-19,-18, -9,-14, 5,-13,-10, -4,-12, 3, 1, -3, -6, -9,-27,-15, 10; /I: MD=-15; /M: SY='K'; M= -9, -1,-27, -2, 6,-26,-16, -8,-25, 27,-25,-11, 1, -4, 8, 21, -5, -5,-19,-23,-13, 6; D=-2; /I: MD=-15; /M: SY='G'; M= 0, -6,-28, -7,-16,-28, 57,-17,-36,-17,-28,-19, 3,-18,-17,-18, 1,-16,-28,-21,-28,-17; D=-2; /I: MD=-15; /M: SY='A'; M= 31, -4,-11,-10, -7,-19, 2,-15,-12, -9,-13,-11, -2,-10, -8,-15, 10, 2, -4,-22,-18, -7; D=-2; /I: MD=-15; /M: SY='F'; M=-16,-22,-19,-28,-21, 53,-22,-14, -2,-22, 7, -1,-15,-24,-28,-15,-16, -9, -3, 5, 22,-22; D=-2; /I: MD=-15; /M: SY='T'; M= 0, 0,-11, -7, -5,-11,-16,-15,-10, -6,-11, -9, 0, -5, -7, -7, 14, 32, -3,-25,-10, -6; D=-2; /I: MD=-15; /M: SY='G'; M= -1, -6,-25, -7,-15,-25, 52,-12,-32,-15,-25,-16, 2,-16,-15,-15, 0,-16,-25,-18,-23,-15; D=-2; /I: MD=-15; /M: SY='A'; M= 33, -8,-10,-14, -7,-17, 3,-16,-10, -8,-10, -9, -7, -9, -8,-14, 7, -1, -2,-17,-17, -7; D=-2; /I: MD=-15; /M: SY='V'; M= -2, -8,-13,-10, -9, -9,-16,-11, 2, -8, -3, -1, -6,-15, -5, -7, -2, 1, 5,-20, -6, -8; D=-2; /I: MD=-15; /M: SY='R'; M= 0, 0,-17, -1, 7,-18, -9, -5,-17, 7,-16,-10, 2, -7, 5, 8, 4, 1,-13,-20,-12, 5; D=-2; /I: MD=-15; /M: SY='D'; M= -2, 7,-17, 8, 4,-18, -5, -4,-16, 0,-15,-11, 6, -8, 2, 1, 4, -2,-13,-22,-12, 2; D=-2; /I: I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; /M: SY='R'; M=-13, -5,-23, -5, 2,-21,-17, 2,-25, 23,-20, -9, 1,-11, 8, 36, -6, -7,-18,-20, -8, 3; D=-2; /I: DM=-15; /M: SY='P'; M= 0,-10,-22,-11, -1,-16,-16,-11, -7, 0, -9, -3, -9, 3, 0, -4, -4, -4, -8,-21,-11, -2; D=-2; /I: DM=-15; /M: SY='G'; M= 1, -8,-26, -8,-17,-27, 59,-18,-35,-18,-27,-18, 1,-18,-17,-18, 3,-15,-26,-20,-27,-17; D=-2; /I: DM=-15; /M: SY='R'; M= -8,-15,-22,-16, -8, -6,-21, -8, -6, 4, 2, 1,-11,-19, -5, 14,-14, -8, -5,-15, -1, -8; D=-2; /I: DM=-15; /M: SY='F'; M=-12,-27,-19,-34,-26, 45,-28,-20, 11,-27, 16, 6,-20,-26,-30,-20,-19, -8, 8, -3, 15,-26; D=-2; /I: DM=-15; /M: SY='E'; M= -9, 6,-26, 12, 39,-27,-18, 1,-24, 9,-18,-14, 0, -5, 20, 5, -1, -9,-23,-26,-16, 29; D=-2; /I: DM=-15; /M: SY='Q'; M= -1,-10,-21,-11, 0,-14,-18, -2, -7, -3, 0, 1, -9,-15, 4, 0, -8, -7, -8,-20, -7, 1; D=-2; /I: DM=-15; /M: SY='x'; /I: DM=-25; /M: SY='x'; /I: DM=-35; /M: SY='x'; /I: DM=-45; /M: SY='x'; /M: SY='x'; /M: SY='x'; /M: SY='x'; /M: SY='x'; /M: SY='x'; /M: SY='x'; /M: SY='I'; M= -8,-30,-25,-36,-29, 0,-36,-29, 41,-27, 17, 16,-23,-19,-22,-27,-18, -8, 32,-23, -3,-29; /M: SY='G'; M= 3, -5,-26, -5, -6,-27, 34,-12,-31,-13,-24,-17, -1,-16,-10,-16, 1,-14,-24,-20,-23, -8; /M: SY='E'; M=-11, 16,-27, 26, 32,-26,-16, 0,-29, 4,-22,-20, 5, -7, 9, -1, 2, -6,-25,-28,-12, 20; /M: SY='M'; M= -8,-24,-21,-30,-20, 5,-26,-12, 20,-20, 29, 33,-23,-24,-11,-16,-22, -8, 10,-18, 2,-16; /M: SY='P'; M= -1, -7,-27, -3, 0,-26,-11,-15,-21, -7,-27,-19, -6, 37, -6,-13, 7, 2,-21,-32,-24, -6; /M: SY='P'; M= -5,-20,-26,-18, -9, -9,-22,-14, -1,-15, 8, 3,-20, 9,-10,-13,-16, -9, -6,-23,-11,-11; /M: SY='E'; M= 3, 5,-22, 7, 14,-25, -9, -7,-21, -1,-19,-14, 2, -6, 5, -4, 7, -2,-17,-29,-18, 9; /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32; /M: SY='L'; M= -5,-22,-18,-26,-18, 8,-22,-17, 10,-21, 24, 15,-21,-23,-16,-17,-16, -3, 8,-19, -2,-17; D=-6; /I: DM=-32; /M: SY='Q'; M=-10, -1,-30, -1, 19,-38,-20, 9,-19, 9,-18, 1, -1,-11, 58, 9, -1,-10,-29,-20,-10, 38; /M: SY='A'; M= 19,-12,-15,-16, -9,-17,-10,-19, -4,-11, -9, -7,-11, -7,-10,-16, 5, 3, 4,-26,-17,-10; /M: SY='K'; M= -6, -4,-26, -6, 4,-24,-18, -5,-23, 30,-21, -5, -2,-13, 8, 25, -7, -7,-16,-21, -9, 5; /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-30,-20, 9,-30,-16, 20,-29, 44, 20,-28,-29,-19,-20,-28,-10, 10,-20, 1,-20; /M: SY='L'; M= -8,-29,-19,-30,-20, 11,-29,-20, 19,-29, 45, 18,-29,-29,-21,-20,-28, -9, 11,-20, 0,-20; /M: SY='R'; M=-16, -8,-29, -9, 1,-20,-19, 1,-27, 26,-20, -9, 1,-19, 12, 56, -8, -9,-20,-19, -8, 2; /M: SY='V'; M= 5,-25,-13,-29,-25, 4,-24,-24, 17,-17, 8, 9,-24,-25,-24,-17, -9, -2, 30,-23, -7,-24; /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-23, 7,-32,-23, 27,-30, 42, 20,-28,-28,-20,-22,-27,-10, 15,-20, 0,-23; /M: SY='Q'; M= -8, 6,-24, 8, 22,-35,-18, 3,-23, 8,-21, -8, 2,-10, 36, 4, 0, -8,-26,-25,-14, 29; /M: SY='E'; M= -7, 11,-26, 17, 32,-26,-16, -1,-25, 4,-20,-16, 4, -7, 13, -2, 4, -4,-24,-29,-14, 22; /M: SY='R'; M= -9, -8,-29, -7, -6,-25, 15, -9,-30, 7,-21,-11, -1,-18, -2, 16, -6,-14,-22,-21,-17, -6; /M: SY='E'; M= -1, -1,-20, 1, 17,-23,-14,-10,-18, 1,-16,-13, -3, -8, 4, -4, 3, 0,-13,-28,-17, 10; /I: MD=-16; /M: SY='F'; M=-11,-26,-20,-31,-25, 24,-30,-18, 20,-23, 14, 9,-21,-25,-24,-19,-17, -7, 17, -7, 15,-25; D=-3; /I: MD=-16; /M: SY='E'; M= -8, 0,-22, 0, 13,-16,-18, -4,-17, 5,-14, -9, 0,-11, 9, 8, 1, 4,-15,-21, -7, 10; D=-3; /I: MD=-16; /M: SY='R'; M=-14,-11,-29, -9, 0,-20,-18, -6,-24, 17,-20,-11, -4, 7, 4, 39, -8, -7,-19,-21,-14, -2; D=-3; /I: MD=-16; /M: SY='V'; M= -4,-27,-14,-29,-25, 4,-28,-25, 26,-22, 20, 12,-26,-26,-24,-19,-15, -4, 33,-23, -5,-25; D=-3; /I: MD=-16; /M: SY='G'; M= 1, -6,-27, -6,-16,-27, 58,-17,-35,-17,-27,-18, 1,-17,-17,-18, 0,-17,-26,-19,-27,-17; D=-3; /I: I=-5; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='G'; M= 6, 2,-19, 3, -2,-24, 20,-12,-26,-10,-23,-18, 3,-12, -7,-13, 11, -2,-18,-26,-21, -5; D=-3; /I: DM=-16; /M: SY='N'; M= -1, 8,-18, 4, 2,-19,-10, -3,-18, 0,-18,-13, 10, -9, 1, 0, 8, 6,-14,-27,-13, 1; D=-3; /I: DM=-16; /M: SY='R'; M= -8, -1,-24, -1, 7,-22,-14, 0,-23, 15,-18, -9, 0,-12, 9, 20, -2, -4,-17,-21,-10, 6; D=-3; /I: DM=-16; /M: SY='T'; M= -5, -6,-14, -7, 0,-14,-15,-14,-13, -6,-12,-10, -7, 1, -6,-10, 0, 6,-10,-23,-12, -4; D=-3; /I: DM=-16; /M: SY='I'; M= -6,-20,-21,-23,-16, -6,-26,-15, 15,-11, 7, 7,-15,-20, -9, -4,-12, -6, 14,-20, -5,-15; D=-3; /I: DM=-16; /M: SY='P'; M= -9, -4,-29, -1, 5,-24,-17, -2,-23, 9,-24,-13, -2, 16, 4, 6, -3, -5,-22,-25,-13, 2; D=-3; /I: DM=-16; /M: SY='V'; M= 0,-21,-15,-22,-20, -3,-25,-23, 15,-17, 5, 4,-19,-21,-21,-16, -6, 1, 25,-28,-10,-21; /M: SY='D'; M=-15, 38,-27, 46, 12,-33, -9, 0,-32, 1,-28,-25, 24, -7, 1, -5, 2, -6,-28,-37,-19, 6; /M: SY='V'; M= -3,-28,-14,-30,-26, 7,-29,-26, 22,-21, 10, 9,-26,-21,-27,-20,-12, -3, 32,-24, -6,-27; /M: SY='R'; M=-19,-10,-27,-10, 0,-20,-20, -1,-28, 27,-18, -9, -1,-20, 10, 62,-10,-10,-19,-21,-10, 1; /M: SY='V'; M= -6,-29,-18,-32,-27, 6,-32,-23, 28,-24, 18, 14,-25,-27,-24,-22,-17, -6, 30,-21, -2,-27; /M: SY='I'; M= -6,-28,-23,-34,-28, -1,-34,-27, 38,-25, 16, 17,-22,-22,-21,-25,-15, -5, 31,-24, -4,-27; /M: SY='A'; M= 27,-11, 11,-19,-13,-20, -2,-20,-16,-14,-15,-13, -9,-17,-12,-20, 8, 0, -5,-27,-21,-12; /M: SY='A'; M= 36, -9,-11,-17,-11,-19, 1,-20,-11,-11,-12,-10, -8,-11,-11,-18, 12, 7, -1,-23,-19,-11; /M: SY='T'; M= 3, 0,-12, -8, -8,-14,-14,-18,-13, -8,-13,-11, 0,-11, -8, -9, 18, 37, -3,-30,-12, -8; /M: SY='N'; M= -8, 13,-19, 4, -1,-21,-10, 23,-19, -3,-22,-10, 24,-18, 6, -2, 4, -2,-21,-33, -8, 1; /M: SY='R'; M= -6, -9,-19,-10, 0,-19,-20, -8,-16, 13,-14, -7, -6,-18, 1, 22, -7, -7, -7,-24,-12, -2; /M: SY='D'; M=-12, 34,-26, 39, 10,-31, -8, 2,-30, -1,-28,-24, 24, -8, -1, -5, 4, -5,-26,-37,-19, 4; /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-29,-19, 7,-29,-20, 19,-28, 42, 17,-28,-22,-19,-20,-27, -9, 8,-21, -2,-19; /M: SY='E'; M= 0, -2,-24, 1, 16,-22,-13, -8,-18, 1,-16,-12, -5, -8, 3, -1, -1, -7,-14,-24,-15, 8; /I: MD=-21; /M: SY='E'; M= 3, 4,-21, 4, 14,-24,-13, -6,-19, 6,-16,-10, 0, -9, 8, 0, 2, -4,-15,-25,-15, 11; D=-4; /I: MD=-21; /M: SY='E'; M= 3, -9,-20, -9, 6,-13,-17, -7, -7, -6, 3, 2,-11,-12, 0, -7, -7, -7, -7,-22,-10, 3; D=-4; /I: MD=-21; /M: SY='V'; M= 1,-25,-11,-28,-25, -2,-25,-24, 25,-18, 10, 13,-24,-24,-22,-19,-10, -2, 34,-25, -8,-24; D=-4; /I: MD=-21; /M: SY='E'; M= 7, -1,-21, -2, 14,-22,-10, -5,-18, 5,-14,-10, -1, -9, 7, 2, 1, -6,-15,-22,-15, 10; D=-4; /I: MD=-21; /M: SY='E'; M= 4, 4,-21, 4, 11,-25, -9, -4,-19, 3,-17,-11, 2,-10, 11, 0, 4, -3,-16,-24,-15, 11; D=-4; /I: MD=-21; /M: SY='G'; M= -1, -4,-26, -6,-14,-26, 52,-15,-34,-14,-27,-18, 5,-18,-15,-14, 1,-15,-26,-21,-26,-15; D=-4; /I: I=-5; MI=0; IM=0; DM=-21; /M: SY='R'; M= -8, -2,-25, -3, 7,-21,-17, -5,-23, 14,-17,-10, 1,-14, 8, 25, -1, 0,-17,-24,-12, 5; /M: SY='F'; M=-17,-27,-20,-37,-28, 67,-28,-19, 2,-28, 9, 1,-17,-28,-36,-20,-18, -9, 1, 5, 24,-28; /M: SY='R'; M=-16,-11,-28,-11, -2,-19,-19, -3,-25, 23,-17, -9, -1,-20, 7, 58, -8, -8,-16,-21,-10, -2; /M: SY='E'; M= 1, 0,-25, 1, 24,-26,-15, -5,-21, 6,-16,-12, -2, -8, 14, 4, 0, -7,-19,-25,-16, 19; /M: SY='D'; M=-19, 42,-30, 60, 20,-39,-11, -1,-38, 2,-29,-27, 16, -5, 3, -8, -1,-10,-30,-38,-20, 11; /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-29,-19, 8,-29,-20, 18,-27, 45, 18,-28,-29,-19,-18,-28, -8, 9,-20, -1,-19; /M: SY='Y'; M=-19,-24,-27,-26,-22, 40,-30, 6, 2,-17, 8, 3,-21,-30,-18,-14,-21,-10, -6, 20, 57,-22; /M: SY='Y'; M=-17,-17,-28,-18,-17, 24,-28, 21, -4,-12, -1, -1,-16,-25,-10,-10,-17, -9,-11, 15, 58,-17; /M: SY='R'; M=-15,-10,-24,-11, -2,-20,-19, -3,-28, 24,-20,-11, -1,-18, 7, 58, -7, -9,-18,-22,-12, -2; /M: SY='L'; M=-11,-29,-22,-31,-21, 10,-31,-20, 21,-27, 42, 18,-27,-28,-19,-17,-28,-10, 11,-19, 1,-21; /M: SY='N'; M= -4, 18,-18, 5, -4,-16, -3, 8,-18, -5,-24,-15, 32,-18, -2, -4, 8, -1,-21,-33,-13, -3; /M: SY='V'; M= 0,-24,-15,-25,-24, -5,-19,-25, 17,-18, 4, 6,-22,-22,-24,-18, -8, -1, 30,-27,-11,-24; /M: SY='V'; M= -7,-24,-19,-29,-25, 16,-26,-21, 16,-22, 12, 8,-21,-25,-24,-19,-15, -5, 18,-13, 4,-24; /M: SY='P'; M= -4, -7,-24, -7, 1,-22,-15,-14,-17, -6,-20,-14, -6, 22, -3, -8, 6, 11,-15,-30,-19, -3; /M: SY='I'; M= -8,-30,-23,-34,-25, 6,-34,-25, 33,-29, 30, 18,-25,-25,-21,-24,-22, -9, 22,-20, 0,-25; /M: SY='H'; M= -4, -2,-22, -6, 1,-18,-17, 5,-15, 2,-16, -7, 2,-14, 5, 5, 2, 3,-11,-26, -7, 1; /M: SY='L'; M= -7,-28,-16,-32,-24, 3,-31,-23, 26,-26, 28, 18,-26,-25,-20,-22,-21, -7, 21,-22, -3,-23; /M: SY='P'; M= -9,-19,-39,-10, 0,-30,-19,-19,-20, -9,-29,-19,-19, 81, -7,-18, -9,-10,-29,-29,-29, -8; /M: SY='P'; M= 2,-14,-30, -9, -1,-27,-12,-18,-19,-10,-27,-18,-13, 54, -8,-18, 2, -3,-22,-30,-26, -8; /M: SY='L'; M= -9,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 49, 20,-30,-30,-20,-20,-29,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='R'; M=-14, -9,-26, -9, 1,-20,-18, -2,-28, 24,-20,-11, 0,-18, 8, 57, -5, -7,-19,-22,-12, 1; /M: SY='E'; M= -7, 8,-27, 15, 39,-30,-18, -1,-25, 7,-19,-15, 0, -5, 18, -1, 0, -8,-24,-29,-18, 29; /M: SY='R'; M=-19,-11,-25,-11, -1,-20,-20, -1,-28, 25,-18, -8, -2,-19, 9, 60,-10,-10,-19,-21,-11, -1; /M: SY='R'; M= -9, -8,-26, -8, -2,-21,-14,-10,-19, 7,-18, -9, -5, -1, 1, 16, -4, -4,-14,-25,-15, -3; /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32; /M: SY='E'; M= -4, 10,-26, 16, 29,-28, -4, -5,-28, 1,-20,-18, 3, -7, 7, -6, 3, -8,-24,-29,-20, 18; D=-6; /I: DM=-32; /M: SY='D'; M=-18, 43,-29, 59, 17,-37, -9, 1,-36, 0,-29,-27, 20,-11, 1, -8, 2, -8,-28,-39,-19, 9; /M: SY='I'; M= -9,-29,-27,-36,-26, 0,-37,-28, 41,-27, 20, 17,-22,-20,-20,-27,-19, -9, 27,-22, -2,-27; /M: SY='P'; M= -6,-15,-31,-10, 2,-21,-20,-16,-10, -7,-13, -8,-15, 31, -6,-12, -9, -8,-15,-27,-19, -5; /M: SY='L'; M= -7,-15,-26,-11, -7,-11,-21,-17, -3,-16, 6, -2,-17, 6,-12,-15,-13, -8, -7,-24,-12,-11; /M: SY='L'; M=-10,-25,-18,-25,-18, 6,-28,-18, 15,-27, 39, 15,-25,-25,-18,-19,-26,-10, 6,-20, 0,-19; /M: SY='A'; M= 17,-18,-13,-25,-18, 0,-14,-22, 3,-18, 2, -1,-15,-18,-18,-20, -1, 1, 9,-19, -9,-18; /M: SY='E'; M=-11, 8,-27, 11, 14,-25,-12, 1,-25, 7,-21,-14, 7,-10, 8, 8, -1, -6,-22,-27,-13, 10; /M: SY='H'; M=-11, -8,-25,-10, -6, -3,-19, 28,-17, -5,-11, -4, -2,-20, 0, 2, -7, -7,-16,-14, 16, -6; /M: SY='F'; M=-15,-27,-21,-33,-23, 47,-28,-15, 4,-24, 16, 6,-21,-28,-28,-16,-21,-10, 1, 0, 22,-23; /M: SY='L'; M= -7,-27,-16,-29,-21, 5,-29,-22, 19,-25, 35, 16,-26,-28,-20,-18,-23, -6, 15,-22, -3,-21; /M: SY='Q'; M= -1, -1,-24, -1, 7,-22, -8, -4,-22, 4,-18,-11, 0,-13, 10, 6, 1, -6,-19,-23,-12, 7; /I: MD=-25; /M: SY='R'; M=-10, -4,-27, -4, 7,-22,-15, -5,-22, 18,-18, -8, -1,-14, 10, 23, -5, -8,-18,-22,-11, 7; D=-5; /I: MD=-25; /M: SY='F'; M= 0,-17,-17,-23,-17, 4,-18, -8, 2,-17, 2, 3,-12,-19,-14,-16, -8, -7, 1,-17, 1,-16; D=-5; /I: MD=-25; /M: SY='A'; M= 11, 0, -5, -5, 1,-21, -3, -8,-20, -6,-19,-15, 4,-14, -4, -9, 9, -1,-14,-30,-19, -2; D=-5; /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25; /M: SY='R'; M= -4, -3,-23, -3, 7,-19,-15, 1,-19, 9,-14, -8, -2,-13, 6, 15, -4, -7,-14,-22,-10, 5; D=-5; /I: DM=-25; /M: SY='E'; M=-10, 2,-27, 5, 19,-25,-17, -2,-25, 12,-18,-12, 1,-10, 13, 18, -3, -7,-21,-26,-14, 14; /I: DM=-25; /M: SY='Y'; M=-11, -6,-22,-10, -7, -3,-18, 1, -7, -9, 0, 1, -3,-20, -2, -6,-10, -6,-10,-17, 3, -5; D=-3; /M: SY='G'; M= -3, -3,-26, -5, -7,-26, 27,-10,-29, -6,-24,-15, 4,-16, -6, -5, 1,-12,-23,-24,-21, -7; D=-3; /M: SY='R'; M= -9,-13,-20,-13, -7,-14,-21, -8,-10, 3, -6, -2, -9,-14, -4, 13, -9, -6, -7,-24, -9, -7; D=-3; /I: MD=-17; /M: SY='P'; M= -2, -2,-24, -2, 4,-20, -8, -9,-20, -2,-21,-14, 0, 9, -1, -4, 3, -1,-18,-26,-17, 0; D=-3; /I: MD=-17; /M: SY='V'; M= -1,-13,-14,-15,-12, -6,-13,-14, 3, -7, -2, 1,-10, -9,-11, -6, -5, -2, 8,-18, -8,-12; D=-3; /I: I=-5; MI=0; IM=0; DM=-17; /M: M= -7,-15,-25,-13, -6,-13,-21,-14, -7, -2, -2, -3,-14, 0, -7, -1,-11, -6, -7,-23,-10, -8; /M: SY='R'; M= -2, -4,-21, -6, -2,-19, -5, -9,-20, 1,-16,-11, -1,-14, -3, 5, 2, 1,-13,-25,-14, -3; /M: SY='F'; M=-12,-29,-21,-34,-26, 25,-31,-23, 21,-27, 24, 12,-24,-27,-26,-20,-22, -9, 16,-13, 7,-26; /M: SY='S'; M= 7, 4,-15, 4, 0,-22, -5, -7,-21, -9,-22,-17, 4, -8, -4,-11, 17, 9,-13,-33,-17, -3; /M: SY='P'; M= 1, 0,-26, 2, 3,-26, -9,-12,-21, -5,-22,-16, -2, 13, -2,-11, 1, -3,-19,-25,-19, -1; /M: SY='E'; M= -2, 9,-25, 15, 18,-28, -7, -6,-26, 0,-20,-17, 2, -5, 6, -6, 4, -6,-22,-29,-19, 12; /M: SY='A'; M= 28,-14,-11,-21,-13,-12, -9,-20, -3,-12, -2, -4,-13,-15,-13,-17, 3, 3, 6,-22,-14,-13; /M: SY='L'; M=-10,-20,-21,-23,-13, 0,-26,-12, 8,-12, 16, 14,-17,-23, -7, -4,-17, -8, 4,-19, -1,-11; /M: SY='E'; M= -2, 4,-25, 3, 11,-26,-11, -4,-23, 9,-20,-12, 4,-10, 9, 10, -1, -7,-20,-26,-16, 9; /M: SY='L'; M= -1,-17,-18,-20,-13, -4,-19,-13, -1,-10, 5, 4,-14,-21, -9, -2, -9, -3, 2,-20, -5,-12; /M: SY='L'; M= -9,-28,-17,-30,-20, 11,-29,-19, 17,-27, 38, 18,-27,-28,-20,-20,-25, -9, 10,-19, 0,-20; /M: SY='M'; M= -5,-12,-20,-15, -5,-12,-19, -9, -1, -7, 2, 9,-10,-15, 0, -5, -7, -3, -2,-24, -9, -3; /M: SY='S'; M= 4, 1,-20, -3, 2,-22, -9, 4,-22, 4,-21,-12, 6,-13, 5, 6, 8, 0,-16,-28,-12, 2; /M: SY='Y'; M=-14,-14,-19,-16,-14, 7,-24, 29,-11,-11, -8, -2,-11,-24, -6, -8,-14,-11,-15, 4, 41,-14; /M: SY='D'; M= 2, 5,-22, 8, 5,-25, -8, -1,-24, -2,-22,-16, 3, -5, 0, -2, 7, -1,-18,-30,-15, 1; /M: SY='W'; M=-20,-36,-44,-38,-28, 21,-22,-26,-16,-19,-15,-16,-35,-29,-22,-18,-35,-25,-24,117, 30,-21; /M: SY='P'; M=-10,-19,-38,-10, 1,-26,-20,-19,-20, -8,-28,-19,-18, 77, -9,-16,-10,-10,-28,-28,-27, -9; /M: SY='G'; M= 0, -8,-29, -9,-19,-29, 65,-19,-39,-19,-30,-20, 2,-20,-19,-19, 2,-18,-29,-21,-29,-19; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='V'; M= -4,-26,-16,-28,-27, 3,-31,-27, 28,-22, 12, 10,-25,-27,-26,-21,-13, -3, 37,-26, -6,-27; /M: SY='R'; M=-19,-11,-30,-11, -2,-16,-17, -2,-29, 25,-19,-10, -1,-20, 6, 62,-10,-10,-20,-19, -9, -2; /M: SY='E'; M=-10, 8,-30, 16, 52,-32,-20, 2,-28, 10,-20,-16, 0, -2, 28, 2, 0,-10,-30,-28,-18, 40; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='E'; M= -7, 4,-27, 7, 27,-25,-17, 0,-24, 12,-20,-14, 2, -9, 13, 9, 0, -7,-22,-26,-12, 19; /M: SY='N'; M= -6, 30,-19, 14, 0,-20, -2, 12,-20, -2,-28,-18, 47,-18, 1, -2, 12, 1,-26,-38,-17, 0; /M: SY='V'; M= 5,-15, 0,-21,-15, -9,-20,-19, 3,-16, 1, 2,-14,-21,-15,-17, -4, 0, 9,-28,-12,-16; /M: SY='I'; M= 1,-26,-15,-31,-25, -1,-28,-25, 26,-23, 17, 13,-23,-24,-21,-23,-14, -5, 26,-24, -7,-24; /M: SY='E'; M=-12, 4,-29, 9, 33,-24,-19, 4,-26, 10,-19,-13, 1, -8, 17, 9, -2, -8,-25,-24,-10, 24; /M: SY='R'; M=-17, -9,-29,-10, -3,-16,-17, -1,-24, 18,-15, -8, 0,-21, 7, 47,-10,-10,-19,-15, -6, -2; /M: SY='A'; M= 14,-17,-11,-24,-16, -4,-14,-17, 2,-18, 6, 5,-15,-19,-14,-19, -4, -2, 5,-22, -9,-15; /M: SY='V'; M= 13,-20, -4,-25,-21, -7,-19,-22, 9,-16, 3, 4,-20,-22,-19,-18, -4, 0, 20,-26,-11,-20; /M: SY='V'; M= 5,-19,-16,-24,-19, -4,-23,-22, 15,-19, 9, 5,-16,-19,-18,-19, -6, 4, 17,-24, -7,-20; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 166 in 166 different sequences |
| Number of true positive hits | 158 in 158 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 8 in 8 different sequences |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 2 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 95.18 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | K_Hofmann |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Sigma-54 factor interaction |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
158 sequences
ACOR_BACSU (O31551), ACOR_CUPNH (P28614), ALGB_PSEAE (P23747), ALGB_PSEPK (Q88RJ6), ALGB_PSESM (Q88AQ2), ANFA_AZOVI (P12626), ATOC_ECOLI (Q06065), DCTD_PSEAE (Q9HU19), DCTD_RHILE (P10046), DCTD_RHIME (P13632), DGAR_SALT1 (D0ZLR9), DHAR_CITFR (P45512), DHAR_ECOLI (P76016), FHLA_ECOLI (P19323), FHLA_SALTS (E1WAA4), FHLA_SALTY (P0CL46), FLBD_CAUVC (P17899), FLEQ_PSEAE (G3XCV0), FLER_PSEAE (Q9I4N3), FLGR_HELPY (O25408), GLRR_ECOLI (P0AFU4), HOXA_BRADU (P31908), HOXA_CUPNH (P29267), HRPR_PSESY (P37930), HRPS_PSESH (P26316), HRPS_PSESY (P37931), HUPR_RHOCA (P26408), HYFR_ECOLI (P71229), LEVR_BACSU (P23914), LIHY_GEOSE (O85057), LUXO_VIBC1 (A7MVC2), LUXO_VIBC3 (O87455), LUXO_VIBCH (Q9KT84), LUXO_VIBHA (P0C5S5), LUXO_VIBPA (Q87MX7), LUXO_VIBVU (Q8CWJ5), LUXO_VIBVY (Q7MM78), MIMR_MYCGD (G3XGC1), MIMR_MYCS2 (A0QTU7), MOPR_ACIGI (Q43965), NIFA_AZOBR (P30667), NIFA_AZOC5 (P09133), NIFA_AZOCH (P56269), NIFA_AZOLI (P54929), NIFA_AZOVI (P09570), NIFA_BRADU (P05407), NIFA_ENTAG (P54930), NIFA_HERSE (P27713), NIFA_KLEOX (P56266), NIFA_KLEPN (P03027), NIFA_RHIEC (P54931), NIFA_RHILE (P09828), NIFA_RHILT (P24426), NIFA_RHIME (P03028), NIFA_RHOCA (P0CY94), NIFA_RHOCB (D5ARW9), NIFA_SINFN (Q53206), NORR1_CUPNH (Q9K4V0), NORR2_CUPNH (Q9K4U8), NORR_AERHH (A0KEJ0), NORR_AERS4 (A4STH5), NORR_ALIF1 (Q5E3W8), NORR_CITK8 (A8ANR6), NORR_ECO24 (A7ZQD8), NORR_ECO27 (B7UHC1), NORR_ECO45 (B7MKH8), NORR_ECO55 (B7LEC0), NORR_ECO57 (Q8X854), NORR_ECO5E (B5Z370), NORR_ECO7I (B7NSI9), NORR_ECO81 (B7MZ04), NORR_ECO8A (B7M9E6), NORR_ECOBW (C4ZYV4), NORR_ECODH (B1XCN6), NORR_ECOHS (A8A3I6), NORR_ECOK1 (A1AEP9), NORR_ECOL5 (Q0TEH1), NORR_ECOL6 (Q8FEN6), NORR_ECOLC (B1IUX0), NORR_ECOLI (P37013), NORR_ECOLU (B7N6T9), NORR_ECOSE (B6I695), NORR_ECOSM (B1LQ27), NORR_ECOUT (Q1R7Z1), NORR_ENT38 (A4WDR5), NORR_ESCF3 (B7LW25), NORR_KLEP3 (B5XVA2), NORR_KLEP7 (A6TCX4), NORR_PECAS (Q6D8R9), NORR_SALA4 (B5F363), NORR_SALAR (A9MFX7), NORR_SALCH (Q57KT4), NORR_SALDC (B5FSZ0), NORR_SALEP (B5QV88), NORR_SALG2 (B5RDG4), NORR_SALHS (B4TF23), NORR_SALNS (B4T3B0), NORR_SALPA (Q5PF20), NORR_SALPB (A9N0D7), NORR_SALPC (C0PWN2), NORR_SALSV (B4TT16), NORR_SALTI (Q8Z4C6), NORR_SALTY (Q8ZMJ8), NORR_SERP5 (A8GG93), NORR_SHIBS (Q31X73), NORR_SHIDS (Q32CL9), NORR_SHIF8 (Q0T1D4), NORR_SHIFL (P59402), NORR_SHISS (Q3YYF5), NORR_VIBVU (Q8D4F9), NORR_VIBVY (Q7MFY9), NTRC_AZOBR (P45671), NTRC_AZOC5 (Q04848), NTRC_BRASR (P10576), NTRC_ECO57 (P0AFB9), NTRC_ECOLI (P0AFB8), NTRC_KLEPN (P03029), NTRC_PROHU (P28787), NTRC_RHIME (P10577), NTRC_RHOCB (P09432), NTRC_SALTY (P41789), NTRXL_RICBR (Q1RJS1), NTRXL_RICCN (Q92HC2), NTRXL_RICFE (Q4UL27), NTRXL_RICPR (Q9ZCY9), NTRXL_RICTY (Q68WH4), NTRX_AZOC5 (Q04849), PGTA_SALTY (P06184), PILR_PSEAE (Q00934), PRPR_ECOLI (P77743), PRPR_SALTY (P74839), PSPF_ECOLI (P37344), QSEF_ECO57 (P0AFU5), ROCR_BACSU (P38022), RTCR_ECOLI (P38035), SFNR_PSEPF (Q3K999), SFNR_PSEPU (Q845S7), STC_CLOBE (P26047), TYRR_CITBR (O54426), TYRR_ECOLI (P07604), TYRR_ENTAG (Q9ZIB7), TYRR_HAEIN (P44694), TYRR_SALTI (P0A2D8), TYRR_SALTY (P0A2D7), UACR_ECOLI (Q46802), VASH_VIBCH (Q9KN48), VNFA_AZOVI (P12627), WTSA_PANSE (P36219), XYLR_PSEPU (P06519), Y4PA_SINFN (P55610), YHYA_PSESN (Q01265), YPLP_BACSU (P54156), YQIR_BACSU (P54529), ZRAR_ECO57 (Q8X613), ZRAR_ECOLI (P14375), ZRAR_KLEOX (Q9APD9), ZRAR_SALTI (Q8Z333), ZRAR_SALTY (P25852)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot 'Partial' sequences |
2 sequences
NTRC_VIBAL (P19905), YFHA_KLEOX (P21710) |
| UniProtKB/Swiss-Prot False positive sequences |
8 sequences
CLPB_PSEPK (Q88Q71), DNLJ_BACVZ (A7Z261), LONB_ARCFU (O29883), LONB_HALSA (Q9HSC3), LONB_PYRAB (Q9UYC6), LONB_PYRHO (O58221), LONB_THEKO (Q8NKS6), LONB_THEVO (P58274)» more |
| PDB [Detailed view] |
23 PDB
1OJL; 2BJV; 2BJW; 2C96; 2C98; 2C99; 2C9C; 2VII; 4QNM; 4QNR; 4QOS; 5EXP; 5EXS; 5EXT; 5EXX; 5NSS; 6J7E; 6JDI; 6JDL; 7EJW; 7QV9; 8P53; 8PB9 » more |