PROSITE entry PS50031

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50031
Entry name [info]	EH
Accession [info]	PS50031
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-MAY-2002 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC50031
Associated ProRule [info]	PRU00077

Name and characterization of the entry

Description [info]

EH domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=91;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=86;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.1558000; R2=0.0226290; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5730.0000000; R2=6.7222223; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=369; H_SCORE=8211; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=281; H_SCORE=7619; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D';  M=-14, 28,-29, 40, 26,-34, -5, -2,-35,  4,-27,-24, 13, -9,  5, -5,  0,-10,-29,-34,-20, 15;
/M: SY='K';  M= -9, -2,-26, -5,  5,-22,-21, -8,-11, 14,-13, -4,  0,-14,  9,  6, -6, -5,-11,-24,-10,  6;
/M: SY='A';  M= 19, -4,-19, -9, -2,-23, -2,-12,-16, -5,-18,-10, -1, -1, -2,-12,  8, -2,-12,-25,-20, -3;
/M: SY='K';  M=-12, -5,-27, -5,  2,-17,-22, -8,-19, 21,-14, -5, -5,-16,  8, 21,-11, -9,-14,-20, -7,  5;
/M: SY='Y';  M=-19,-24,-26,-27,-24, 42,-30,  5,  2,-17,  4,  1,-21,-30,-20,-14,-19, -9, -3, 20, 59,-24;
/M: SY='E';  M= -9, 13,-30, 20, 21,-24,-14, -4,-27, -1,-23,-21,  3, -3,  3, -8, -2, -9,-26,-14,-11, 12;
/M: SY='E';  M= -2,  4,-25,  6, 20,-30,-13, -5,-25, 14,-23,-13,  1, -8, 16,  5,  3, -4,-21,-26,-15, 18;
/M: SY='I';  M=-12,-25,-28,-32,-22,  6,-35,-19, 28,-20, 15, 13,-19,-22,-14,-20,-19,-10, 14,-13,  9,-21;
/M: SY='F';  M=-20,-27,-23,-33,-27, 63,-30, -6,  0,-23,  7,  0,-20,-30,-30,-17,-20,-10, -3, 17, 47,-27;
/M: SY='D';  M= -6,  5,-23,  6,  5,-20,-14,  1,-18, -2,-11,-10,  4,-15,  2,  1,  1, -4,-16,-30,-12,  3;
/M: SY='S';  M=  2,  2,-20,  2,  5,-27, -6, -6,-23,  4,-24,-13,  4,-11, 13,  2, 14,  4,-17,-29,-16,  9;
/I:         MD=-32;
/M: SY='V';  M=  0,-12,  1,-16,-13,  0,-16,-15,  3,-14,  5,  1,-11,-15,-13,-13, -4,  5,  7,-17, -5,-13; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M: SY='R';  M= -1, -5,-20, -6,  2,-18,-14, -8,-16, 11,-14, -8, -1,-14,  1, 17, -1, -4, -8,-23,-12,  0; D=-3;
/M: SY='P';  M= -1, -5,-25, -2,  7,-22,-15,-14,-17, -4,-18,-14, -8, 26, -4,-11,  0,  2,-17,-27,-19,  0; D=-3;
/M: SY='I';  M= -8,-23,-22,-27,-20,  7,-22,-22, 14,-18,  9,  6,-18,-16,-20,-17,-15, -7, 11,-16, -2,-21; D=-3;
/M: SY='F';  M=-13,-26,-19,-30,-22, 32,-27,-14, 11,-25, 28, 13,-23,-27,-23,-17,-23, -9,  4, -5, 16,-21; D=-3;
/M: SY='M';  M= -5,-14,-20,-16, -6, -7,-19, -8,  0, -3,  6, 12,-13,-18, -4, -1,-10, -6,  0,-19, -3, -5; D=-3;
/M: SY='N';  M= -5,  4,-19,  0,  0,-16,-11,  0,-19,  9,-22,-12, 10,-13,  1,  6,  9,  7,-15,-25, -6,  0; D=-3;
/M: SY='S';  M=  6, -5,-11, -8, -6, -8, -7,-12,-12,-12,-15,-12,  2,-12, -6,-11, 23, 16, -5,-29,-12, -6; D=-3;
/M: SY='G';  M= -6,  1,-27,  1, -7,-26, 29,-11,-33,  0,-26,-17,  6,-17, -8,  3, -2,-14,-25,-22,-21, -8; D=-3;
/M: SY='L';  M= -8,-28,-18,-28,-20,  8,-28,-20, 21,-27, 41, 18,-27,-27,-19,-19,-25, -8, 14,-19, -1,-20; D=-3;
/M: SY='P';  M= -7, -2,-27,  2,  1,-25,-12,-11,-20, -6,-26,-18, -1, 39, -5,-10,  3, -1,-23,-31,-23, -5; D=-3;
/M: SY='D';  M= -4,  7,-24,  9,  2,-26, -8, -7,-21,  3,-19, -9,  3, -9,  3, -1,  0, -6,-16,-28,-16,  2;
/M: SY='Q';  M= -4,  5,-23,  6,  6,-24,-16, -4,-16, -5,-16,-11,  2, -4,  7, -8,  5,  5,-16,-30,-14,  6;
/M: SY='V';  M= -7, -7,-21, -7,-11,-12,-25,-17,  8,-15,  5,  2,-12,-20,-10,-16, -8, -1, 10,-27, -9,-11;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-21,-31,-21,  9,-31,-21, 23,-30, 47, 20,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 12,-20,  0,-21;
/M: SY='G';  M= 12, -1,-20, -5, -4,-24, 17,-12,-25, -7,-23,-16,  5,-14, -6, -7,  8, -5,-18,-26,-22, -5;
/M: SY='H';  M=-12, -1,-27, -1,  9,-26,-18, 19,-26, 16,-23, -7,  3,-13, 18, 19, -2, -7,-23,-25, -5, 12;
/M: SY='I';  M= -2,-28,-22,-35,-28, -2,-34,-29, 39,-25, 14, 14,-22,-22,-22,-26,-14, -6, 33,-23, -5,-28;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='B';  M=  5, 14,-19, 14,  9,-21, -7, -7,-22, -4,-21,-19, 11,-11, -1,-10, 11,  2,-17,-32,-17,  4;
/M: SY='L';  M= -5,-27,-19,-28,-19,  7,-27,-20, 16,-27, 42, 16,-27,-27,-19,-19,-24, -5,  9,-21, -2,-19;
/M: SY='A';  M= 16,-16, 15,-22,-18,-14,-15,-23, -3,-18, -9, -7,-13,-21,-17,-21,  5,  1,  9,-32,-18,-18;
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M: SY='F';  M= 11,-19,-10,-26,-19, 14,-17,-19, -1,-19,  1, -3,-15,-21,-20,-20, -3, -3,  3,-13,  1,-19;
/M: SY='V';  M= -2,-25,-19,-26,-20, -1,-26,-19, 17,-20, 13, 10,-23,-16,-19,-19,-12, -4, 18,-22, -2,-21;
/M: SY='A';  M= 27,-14, -7,-23,-15, -2, -6,-20, -9,-16, -4, -7,-12,-16,-17,-20,  2, -1, -1,-17,-11,-15;
/M: SY='M';  M=-10,-23,-20,-30,-20, 12,-24,-11, 16,-19, 22, 32,-20,-23,-12,-15,-18, -7,  8,-18,  2,-16;
/M: SY='H';  M=-14,-10,-28,-13, -7, -5,-22, 29,-16,  1,-12, -2, -3,-20,  0, 13,-11,-13,-15,-16, 13, -7;
/M: SY='L';  M= -9,-26, -9,-28,-19,  8,-27,-19, 12,-27, 35, 15,-25,-28,-19,-19,-22, -7,  6,-23, -3,-19;
/M: SY='I';  M= -5,-27,-20,-32,-26,  0,-32,-27, 33,-25, 16, 13,-22,-24,-22,-23,-13, -4, 31,-25, -5,-26;
/M: SY='A';  M=  5,  0,-21, -6, -4, -8,-12, -2,-14, -4,-14, -9,  3,-17,  2, -3,  0, -5,-14,-15,  1, -2;
/M: SY='Q';  M= -8, -4, -7, -4, -3,-19,-17, -5,-17, -4, -9, -4, -7,-20,  6, -3, -8,-10,-15,-22, -6,  1;
/M: SY='A';  M= 11,-12,-11,-16, -8,-17,-14,-15,-12,  4, -8, -4,-10,-17, -5,  4, -4, -5, -4,-23,-14, -7;
/M: SY='Q';  M=-10, -7,-23,-10, -3,-16,-21,  3, -3, -6,  2,  6, -4,-20, 11, -3,-10, -8, -7,-25, -6,  3;
/M: SY='N';  M= -5, 12,-24,  9, 12,-26,-12, -1,-20,  4,-23,-14, 16,-12, 12,  3,  6, -3,-21,-31,-16, 12;
/M: SY='G';  M=  0, -8,-27, -9,-11,-26, 32,-11,-30, -5,-22,-13, -2,-18,-11, -8, -3,-14,-22,-21,-20,-11;
/I:         MD=-17;
/M: SY='G';  M= -4,  0,-16,  1,  4,-15,  6,  0,-16,  0,-14, -9,  2,  0, -1, -2, -2, -7,-15,-14,-10,  1; D=-3;
/I:         I=-5; MI=0; IM=0; DM=-17;
/M: SY='E';  M= -6, -5,-26, -3,  4,-14,-20, -5, -8, -7, -7, -7, -6, -3, -4,-11, -7, -7,-10,-23, -6, -2;
/M: SY='E';  M= -7,  0,-25,  5, 13,-25,-17,-10,-20, -1,-21,-16, -3, 11,  2, -3,  5,  2,-17,-31,-19,  6;
/M: SY='I';  M= -2,-25,-22,-29,-22, -6,-29,-27, 24,-21,  7,  7,-21, -5,-20,-23,-11, -3, 21,-25,-10,-24;
/M: SY='P';  M= -9,-13,-36, -7,  0,-28,-17,-17,-20, -9,-29,-20,-11, 72, -9,-17, -5, -5,-28,-31,-28, -9;
/M: SY='S';  M=  0, -2,-20, -3, -4,-13,-14,  0,-14, -4,-11, -6, -1,-16, -1, -2,  2,  0,-11,-21, -1, -4;
/M: SY='S';  M=  0, -8,-16, -8,  1,-16,-16,-13, -5, -9,-10, -7, -6,-15,  0,-10, 11,  8,  2,-32,-14,  0;
/M: SY='L';  M= -8,-22,-20,-25,-18,  4,-26,-18, 17,-26, 33, 13,-19,-26,-17,-19,-19, -6,  8,-23, -3,-18;
/M: SY='P';  M= -6,-15,-32, -9, -4,-20,-19,-16,-14,-11,-18,-14,-16, 48,-10,-18, -7, -5,-20,-25,-16,-10;
/M: SY='S';  M= -1,  6,-21,  7, -1,-22,-10,-11,-16, -9,-20,-16,  6,  6, -6,-13,  8,  3,-14,-34,-20, -5;
/M: SY='Q';  M= -5, -5,-24, -4,  3,-13,-14, -3,-17, -6,-15,-11, -2,-12,  4, -7,  3, -3,-17,-12, -7,  4;
/M: SY='L';  M=  1,-20,-16,-23,-15, -1,-20,-17,  8,-21, 23, 12,-18,-22,-13,-17,-10,  1,  5,-24, -6,-14;
/M: SY='I';  M= -6,-26,-24,-31,-22,  3,-29,-23, 19,-17, 11, 10,-21,-23,-18,-13,-17, -9, 16,-10, -1,-21;
/M: SY='P';  M= -6, -3,-32,  1,  7,-30,-16, -6,-21, -4,-26,-16, -3, 41,  4,-11, -4, -8,-27,-30,-22,  3;
/M: SY='P';  M= -3,-10,-27, -6,  3,-25,-12,-15,-17, -8,-24,-16, -8, 32, -2,-13,  6,  1,-17,-31,-23, -2;
/M: SY='S';  M=  1,-10,-10,-11, -8,-12,-13,-16,-12,-14,-20,-14, -3,  7,-11,-16, 10,  3, -9,-31,-17,-11;
/M: SY='K';  M= -7,  2,-25,  2,  8,-20,-15, -7,-25, 14,-23,-14,  4, -6,  3, 14,  1, -3,-19,-26,-13,  5;
/M: SY='R';  M= -4, -7,-21,-13, -9,  0,-16,-10,-12,  1, -8, -6,  0,-20, -8,  9, -6, -5, -8,-19, -5, -9;
/M: SY='H';  M= -4, -3,-27, -5, -1,-18, -7,  4,-20, -2,-19, -9,  2,  3, -4, -6, -4, -9,-20,-26,-12, -4;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_01 which contains 572'970 sequence entries.

Total number of hits	200 in 115 different sequences
Number of true positive hits	199 in 114 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	1
Number of false negative sequences	7
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	99.50 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	96.60 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	3
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	K_Hofmann
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	EH
Version [info]	5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences	114 sequences EDE1_YEAST (P34216), EHD1_ARATH (Q94CF0), EHD1_BOVIN (Q5E9R3), » more Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format] Retrieve the sequence logo from the alignment
UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences	7 sequences IRS4_BOTFB (A6S9V4), IRS4_KLULA (Q6CSC2), IRS4_SCLS1 (A7EDF3), » more
UniProtKB/Swiss-Prot False positive sequences	1 sequence SNTAN_BOVIN (Q0P561)
PDB [Detailed view]	22 PDB 1C07; 1EH2; 1F8H; 1FF1; 1FI6; 1IQ3; 1QJT; 2JQ6; 2JXC; 2KFF; 2KFG; 2KFH; » more